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带领研究团队深入开展大叶茶、油茶和云南山茶的比较功能基因组学研究与茶种资源的保护与发掘利用，在国际上首次启动并领衔完成了茶树基因组并在植物学顶尖期刊Molecular Plant发表，成功地揭示了茶叶风味、适制性及茶树全球生态适应的遗传学基础，论文一经发表后引起了非常强烈的反响，被CCTV（新闻联播）、CNN、华盛顿邮报等几乎所有国内外重要的新闻媒体报刊的采访、报道或转载。最近，他带领的研究团队首次完成了三七基因组计划并解析三七人参皂苷的生物合成途径，对指导三七、人参和西洋参的育种、种植与深加工产业的发展具有重要意义。
在国家大科学装置“中国西南野生生物种质资源库”创建了“植物种质资源与基因组学研究中心”及人才团队，主导购置了国际一流的基因组学与生物信息学研究平台，卓有成效地推动着“植物种质资源与基因组学”学科在我国西南的建设与发展并已在国内外日益产生重要影响
2015.6-至今: 中国科学院昆明植物研究所博士生导师，研究员，中国科学院特聘研究员，中国科学院 “一三五”植物种质资源与基因组学研究群组群长。
2014.1-至今: 云南省热带作物科学研究所橡胶工程中心首席研究员，热带作物种质资源与基因组学重点实验室主任
2012.1-2016.12: 昆明理工大学生命科学与技术学院、信息与自动化学院特聘教授，博士生导师
2011.7-9 美国佐治亚大学遗传学系任 Visiting Faculty，合作教授为Jeffrey Lynn Bennetzen 院士
2006.6-2014.12: 中国科学院昆明植物研究所博士生导师，研究员；任国家大科学装置中国西南野生生物种质资源库副主任；植物种质资源与基因组学研究中心主任。
2006.05至2007.05: 在美国德克萨斯大学奥斯丁分校分子细胞与发育生物学系任Research Assistant Professor，对拟南芥异源四倍体形成后基因表达的进化机制开展了比较功能基因组学研究。
2005.01至2006.04: 在美国休斯顿大学生物与生物化学系任Research Assistant Professor, 与国际著名的分子进化生物学家Dan Graur教授在分子进化和生物信息学等领域开展合作，进行了LTR-反转座子对水稻基因组大小进化和基因表达与分化的影响等研究。
2003.07至2004.12: 在美国德克萨斯大学休斯顿分校的人类遗传学中心任Research Fellow, 合作导师为Hideki Innan教授。在理论群体遗传学和比较基因组学等国际前沿的学科在理论上得到系统的学习和训练，进行了基因重复的分子进化机制以及水稻的驯化与人工选择的理论群体遗传学等研究。
2002.07至2003.06: 在美国密西根大学(Ann Arbor) 生态与进化生物学系任Research Fellow, 合作导师为张建之教授。在此期间，在分子进化、生物信息学和进化基因组学等国际前沿学科和理论上得到了系统的学习和训练，进行了人类特有年轻重复基因的分子进化、与人类致病基因同源的基因在老鼠及其近缘物种中的群体遗传学和分子进化机制等方面的研究。
2000.11至2002.06: 在美国佐治亚大学遗传学系Susan Wessler 院士和John F. McDonald教授指导下作博士后研究。开始在分子进化、生物信息学和基因组学等前沿学科领域上接受了系统的学习和训练，进行了水稻LTR-反转座子在基因组中的进化研究。
1999.11至2000.11: 被遴选为联合国粮农组织下属的国际植物遗传资源研究所的Vavilov-Frankel Fellow，赴美国华盛顿大学(圣路易斯)生物学系在 Barbara A. Schaal 院士指导下作博士后研究。在此期间系统地学习和加强了群体遗传学、谱系地理学、分子系统学和保护遗传学的基础理论，开展了普通野生稻的群体遗传结构与原生境保护研究。
1999.10至2000.11: 任中国农业科学院作物品种资源研究所稻种资源研究室副研究员，主要从事水稻分子育种和我国稻种资源的研究、保护与利用。
1998.08至1998.09: 在国际水稻研究所（IRRI）作访问科学家，进行了稻种资源的保护和基因库管理以及稻属植物的分类学研究。
1997.08至1999.09: 在中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点实验室董玉琛院士指导下作博士后研究。在此期间系统地学习了植物种质资源学的基础理论和分子标记育种的技术，对我国稻种资源开展了基于水稻遗传图谱的遗传多样性、亚洲栽培稻的起源与驯化、野生稻的分子生态学和保护遗传学等方面的研究。
1991.08至1994.07: 在云南大学生物系植物学专业胡志浩教授指导下获得理学硕士学位，从事禾本科植物的分类，系统与进化研究
1987.09至1991.07: 在云南大学生物系植物学专业获得理学学士学位。
1999年获得联合国粮农组织下属的国际植物遗传资源研究所(Biodiversity International)（原名为IPGRI）授予的Vavilov-Frankel Fellow。该奖项从全世界约1000余名申请人中，每年仅授予两名年轻优秀的科学家。
2008年入选中国科学院 “百人计划”并获得“引进国外杰出人才”的择优支持。
2008年入选云南省首届引进高端科技人才并获得云南省高层次科技人才培引工程专项人才基金的支持。
2009年入选人力资源社会保障部、科技部、教育部、财政部、国家发改委、国家自然科学基金委、中国科协等七部委联合设立的“新世纪百千万人才工程”国家级人选。
2011年入选云南省委首批“百名海外高层次人才引进计划”。
2011年入选云南省委联系专家。
2011年获得何梁何利科学技术青年创新奖。
2012年享受国务院政府特殊津贴。
2013年入选科技部推进计划中青年科技创新领军人才
2014年领衔入选“热带作物种质资源与基因组学”云南省创新团队。
2015年批准建立云南省委基层专家工作站。
2016年入选第三批中共中央组织部“万人计划”（“特支计划”）科技创新领军人才。
任The Open Ecology Journal（2008－2010），The Open Conservation Biology Journal（2008－ ），American Journal of Plant Sciences（2010－ ），Frontiers in Plant Genetics and Genomics和International Journal of Genomics and Proteomics（2010－ ）等国际刊物的编委；
任中国科学院昆明植物研究所学术委员会委员（2009-2014）；
任中国科学院热带植物可持续利用重点实验室学术委员会委员（2013 -2018）；
任中国茶叶标准委员会委员（2012-2017）；
担任中国生物工程学会生物资源专业委员会委员
American Association for the Advancement of Science高级会员（Senior Membership）
Sigma Xi高级会员（Senior Membership）
American Society of Botany会员
Society for Molecular Biology and Evolution会员
The Society for the Study of Evolution会员
American Genetic Association 会员
Society for Conservation Biology会员
中国植物学会会员
中国遗传学会会员
性与保护生物学研究（1997.8-2002.12），3.6万美元，已顺利结题。
(2) 联合国粮农组织国际植物遗传资源研究所（IPGRI）：利用SSR评价中国普通野生稻的群体遗传结构及其原生境保护的研究（1999.5-2002.5），1.5万美元，已顺利结题。
(3) 国家自然科学基金(30025005)：颗粒野生稻的群体遗传结构和濒危机制的研究（1998.1-2001.12），12.5万，已顺利结题。
(4) 中国博士后管理委员会项目：亚洲栽培稻及其野生近缘植物基于遗传图谱的遗传多样性研究（1997.8-1999.9），4万，已顺利结题。
(5) 中国科学院“九五”重大项目(KZ951-B1-102)：中国药用野生稻的遗传多样性和保护生物学研究（“中国重要珍稀濒危植物的保护生物学研究”子专题，1998.6-2002.12），4万，项目主持人为洪德元院士和葛颂研究员，本人为子课题主持人, 已顺利结题。
(6) 中国科学院知识创新工程方向性重点项目(KSCX2-YW-N-029)：重要野生禾本科植物的比较基因组学和重要功能基因的研究(2007.1-2009.12)，130万，执行中。
(7) 国家科技部“973 ”项目(2007CB815701)：重要栽培植物的人工选择与基因组进化（2007.1-2012.12），60万 ，子专题负责人，执行中。
(8) 中国科学院昆明植物研究所 “百人计划” 引进人才启动项目（51O602511121）：栽培稻及野生近缘植物的进化与比较功能基因组学研究（2007.1-2010.12），73万，执行中。
(9) 中国科学院昆明植物研究所创新三期领域前沿重点项目（672705232515）：云南大叶茶的种质资源与基因组学的初步研究（2008.1-2012.12），80万，执行中。
(10) 云南省自然科学基金重点项目（2008CC016）：云南大叶茶的起源及其重要品质相关基因的比较功能基因组学研究（2009.1-2011.12），45 万元，执行中。
(11) 中国科学院“百人计划”择优支持项目：云南大叶茶、云南山茶花和油茶的比较功能基因组学与种质资源的初步研究（2009.1-2011.12），200万元，执行中。
(12) 云南省高端科技人才引进项目（20080A009）：云南大叶茶重要品质相关
基因的比较功能基因组学研究（2009.1-2011.12），300万元，执行中。
（13）国家自然科学基金NSFC-云南联合基金项目（U0936603）：油茶、云南大叶茶和云南山茶种质资源的保护和比较功能基因组学研究”（2010.1-2013.12）,185万元，执行中。
（14）云南省自然科学基金重点项目：云南普通野生稻种质资源和基因组学的初步研究（2011.1-2013.12），40万，执行中。
（15）云南省农业创新行动计划：云南大叶茶种质资源和基因组学研究（2011.1-2015.12），180万，执行中。
（16）云南省农业创新行动计划：橡胶树种质资源和基因组学研究（2014.1-2016.12），500万，执行中。
（17）中组部“万人计划”科技创新领军人才项目（2017-2020），100万，执行中
（18）华南农业大学引进人才科研启动项目，500万
（19）华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心建设项目，2000万
2）参加的主要研究项目：
（1） 中国科学院分类与区系特别资助费项目：稻属的分子系统学与进化研究（1994-1997），10.5万，项目主持人为洪德元，已顺利结题。
（2） 中国科学院院长基金：中国稻属的进化植物学和保护生物学研究（1994-1997），10万，项目主持人为洪德元，已顺利结题。
（3） 国家“973”重大项目子专题：中国稻种资源核心种质的研究与构建（1998-2002），150万，主持人为李自超等，已顺利结题。
（4） 中国农业部“95”科技攻关项目：野生稻(Oryza longistaminata and O. rufipogon)中抗稻瘟病和白叶枯病优异基因的导入与水稻的分子标记育种（1997-2000），60万，主持人为刘旭和庞汉华，已顺利结题。
（5）美国国家国家自然科学基金植物基因组项目：植物转座子和水稻基因组进化（2000-2005），120万美元，主持人为 Susan Wessler，已顺利结题。
（6）美国国立卫生研究所项目：年轻重复基因的功能分化进化机制的研究（2002-2007），100万美元，主持人为Jian-zhi Zhang，已顺利结题。
（7）美国德克萨斯大学休斯敦分校启动基金：利用人和啤酒酵母及其近缘物种基因组数据进行群体遗传学研究（2003-2006），30万美元，主持人为 Hideki Innan，已顺利结题。
（8）美国休斯敦大学特聘教授启动基金：利用模式生物基因组信息进行分子进化和生物信息学研究（2004-2007），40万美元，主持人为 Dan Graur，已顺利结题。
（9）美国国家自然科学基金植物基因组项目：植物多倍化的比较功能基因组学基础（2005-2010），300万美元，主持人为Jeff Chen，参加人之一，执行中。
（10）中科院知识创新工程方向性重点项目：高山流石滩植物适应冷热胁迫快速交替的机制研究（2007-2009），100万，主持人为李唯奇，参加人之一，执行中。
92 Xi Du, Qi Zhao, En-Hua Xia, Gao L. Z., Franck Richard, Zhu L. Yang. Mixed-reproductive strategies, competitive mating-type distribution and life cycle of fourteen black morel species. Scientific Reports 7: 1493 |DOI:10.1038/s41598-017-01682-8
91 Jia-huan Xu, Hai-bo Wu, Gao L. Z.*. 2017. The complete chloroplast genome sequence of the threatened trident maple Acer buergerianum (Aceraceae). Mitochondrial DNA Part B (accepted)
90 Qun-Jie Zhang，Gao L. Z.*. 2017. Rapid and recent evolution of LTR retrotransposons drives rice genome evolution during the speciation of AA- genome Oryza species. G3-Genes Genomes Genetics https://doi.org/10.1534/g3.116.037572
89 Wei Li, Yuan Liu, Gao L. Z.*. 2017. The complete chloroplast genome of the endangered wild Musa itinerans (Zingiberales: Musaceae). Conservation Genetics Resources DOI: 10.1007/s12686-017-0737-x
88 Ge-Ran Hutang, Gao L. Z.*. 2017. The complete chloroplast genome sequence of Leersia perrieri of the rice tribe Oryzeae (Poaceae). Conservation Genetics Resources DOI: 10.1007/s12686-017-0729-x
87 En-Hua Xia, Hai-Bin Zhang, Jun Sheng, Kui Li, Qun-Jie Zhang, Changhoon Kim, Yun Zhang, Yuan Liu, Ting Zhu, Wei Li, Hui Huang, Yan Tong, Hong Nan, Cong Shi, Chao Shi, Jian-Jun Jiang, Shu-Yan Mao, Jun-Ying Jiao, Dan Zhang, Yuan Zhao, You-Jie Zhao, Li-Ping Zhang, Ben-Ying Liu, Yue Yu, Sheng-Fu Shao, De-Jiang Ni, Evan E. Eichler, Gao L. Z.*. 2017. The tea tree genome provides insights into tea flavor and independent evolution of caffeine biosynthesis. Molecular Plant (http://dx.doi.org/10.1016/j.molp.2017.04.002)
86 En-Hua Xia, Da-Rong Yang, Jian-Jun Jiang, Qun-Jie Zhang, Yuan Liu, Yun-Long Liu, Yun Zhang, Hai-Bin Zhang, Cong Shi, Yan Tong, Changhoon Kim, Hua Chen, Yan-Qiong Peng, Yue Yu, Wei Zhang, Evan E. Eichler, Gao L. Z.*. 2017. The caterpillar fungus, Ophiocordyceps sinensis, genome provides insights into highland adaptation of fungal pathogenicity. Scientific Reports (accepted)
85 Dan Zhang, Wei Li, En-hua Xia, Qun-jie Zhang, Yuan Liu, Yun Zhang, Yan Tong, Yuan Zhao, Yong-chao Niu, Jia-huan Xu, Gao L. Z.*. 2017. The medicinal herb Panax notoginseng genome provides insights into ginsenoside biosynthesis and genome evolution. Molecular Plant DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.molp.2017.02.011
84 Fan-chun Zeng, You-Jie Zhao, Que-jie Zhang, Gao L. Z.*. 2017. LTRtype, an efficient tool to predict structurally complex LTR retrotransposon elements and nested insertions. Frontiers in Plant Science 8:402. doi: 10.3389/fpls.2017.00402
83 T Mornkham, PP Wangsomnuk, XC Mo, FO Francisco, Gao L. Z., H Kurzweil. 2016. Development and characterization of novel EST-SSR markers and their application for genetic diversity analysis of Jerusalem artichoke (Helianthus tuberosus L.). Genetics and Molecular Research: GMR doi: 10.4238/gmr15048857
82 Huang J, Zhang C, Zhao X, Fei Z, Wan K, Zhang Xiaoming Pang, Yin X, Bai Y, Sun X, Gao L. Z., Li R, Zhang J, Li X. 2016. The jujube genome provides insights into genome evolution and the domestication of sweetness/acidity taste in fruit trees. PLoS Genetics 12(12): e1006433. doi:10.1371/journal.pgen.1006433
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79 Cheng-wen Gao, Gao L. Z.*. 2016. The complete chloroplast genome sequence of wild soybean, Glycine soja (Fabales: Fabaceae). Conservation Genetics Resources (DOI 10.1007/s12686-016-0659-z)
78 Dan Zhang, Yuan Liu, Gao L. Z.*. 2016. The complete chloroplast genome sequence of Phyllostachys heterocycla, a fast-growing non-timber bamboo (Poaceae: Bambusoideae). Conservation Genetics Resources (DOI: 10.1007/s12686-016-0654-4)
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75 Chao Shi, Shuo Wang, En-Hua Xia, Jian-Jun Jiang, Fan-Chun Zeng, Qiu-Yang Yao, and Gao L. Z.*. 2016. Full transcription of the photosynthetic eukaryote chloroplast genome. Scientific Reports 6 doi:10.1038/srep30135
74 Gao L. Z.*, Cheng-wen Gao. 2016. Lowered diversity and increased inbreeding depression within peripheral populations of an endangered wild rice Oryza rufipogon. PLoS ONE 11(3): e0150468. doi: 10.1371/journal.pone.0150468
73 Qiu-Yang Yao, Hui Huang, Yan Tong, Gao L. Z.*. 2016. Transcriptome sequencing reveals gene expression profiles of flavonoid and fatty acid biosynthesis pathways and the development of EST-SSR markers in Camellia reticulata (Theaceae). Frontiers in Plant Science doi: 10.3389/fpls.2016.00163
72 En-Hua Xia*, Qiu-Yang Yao*, Hai-Bin Zhang, Jian-Jun Jiang, Li-Ping Zhang, Gao L. Z.*. 2016. CandiSSR: an efficient pipeline used for identifying candidate polymorphic SSRs based on multiple assembled sequences. Frontiers in Plant Science 6:1171. doi: 10.3389/fpls.2015.01171
71 Wang S, Shi C, Zhang YJ, Hu GX, Gao L. Z.*. 2016. Trading away ancient amber's secrets. Science 351(6276):926. doi: 10.1126/science.351.6276.926-a.
70 Ning Wang, Gao L. Z.* 2015. Genome-wide analysis of WRKY family of transcription factors in common bean, Phaseolus vulgaris: chromosomal localization, protein structure, evolution and expression divergence. Plant Gene 5: 22–30
69 Shuo Wang, Gao L. Z.* 2015. Complete chloroplast genome sequence of green foxtail (Setaria viridis), a promising model system for C4 photosynthesis. Mitochondrial DNA: 1-2. DOI:10.3109/19401736.2015.1079867
68 Shuo Wang, Gao L. Z.* 2015. Complete chloroplast genome sequence of an irreplaceable dietary and model crop, foxtail millet (Setaria italica). Mitochondrial DNA: 1-2. DOI: 10.3109/19401736.2015.1089562
67 Shuo Wang, Cheng-wen Gao, Gao L. Z.* 2015. Plastid genome sequence of an ornamental and editable fruit tree of Rosaceae, Prunus mume. Mitochondrial DNA: 1-2. DOI:10.3109/19401736.2015.1089546
66 Jie Zhang, Xiang-dong Liu, Gao L. Z.*. 2015. Methylome of autotetraploid rice revealed DNA methylation variation of transposable elements and their effects on gene expression. Proc Natl Acad Sci USA 112(50): E7022–E7029
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64 Dan Zhang, Wei Li, Chengwen Gao, Yuan Liu, Gao L. Z.* 2015. The complete plastid genome sequence of Panax notoginseng and comparative chloroplast genomics of the family Araliaceae. Mitochondrial DNA: 1-2. DOI: 10.3109/19401736.2015.1063131
63 Bang Liu, Gao L. Z.* 2015. The complete chloroplast genome sequence of Cucumis sativus var. Hardwickii, the wild progenitor of cultivated cucumber. Mitochondrial DNA: 1-2. DOI: 10.3109/19401736.2015.1101588
62 Jie Zhang, Dan Zhang, Chao Shi, Ju Gao, Gao L. Z.*. 2015. The complete chloroplast genome sequence of Chikusichloa aquatica (Poaceae: Oryzeae). Mitochondrial DNA: 1-2. DOI:10.3109/19401736.2015.1053058
61 Bang Liu, Xiao-di Hu, Gao L. Z.* 2015. The complete mitochondrial genome of the central chimpanzee, Pan troglodytes troglodytes. Mitochondrial DNA: 1-2. DOI:10.3109/19401736.2015.1053060
60 Hai-Bin Zhang, En-Hua Xia, Hui-Huang, Jian-Jun Jiang, Ben-ying Liu and Gao L. Z.*. 2015. De novo transcriptome assembly of the wild relative of tea tree (Camellia taliensis) and comparative analysis with tea transcriptome identified putative genes associated with tea-quality and stress response. BMC Genomics 16:298 (DOI: 10.1186/s12864-015-1494-4)
59 Qiu-yang Yao, En-hua Xia, Fei-hu Liu, Gao L. Z.* 2015. Genome-wide identification and comparative analysis of expression profiling reveal a rapid expansion and functional divergence of duplicated genes of WRKY gene family in cabbage, Brassica oleracea var. capitata. Gene 557(1):35-42.
58 Qun-jie Zhang, Qun-jie Zhang, Ting Zhu, En-hua Xia, Chao Shi, Yun-long Liu, Yun Zhang, Yuan Liu, Wen-kai Jiang, You-jie Zhao, Shu-yan Mao, Li-ping Zhang, Hui Huang, Jun-ying Jiao, Ping-zhen Xu, Qiu-yang Yao, Fan-chun Zeng, Li-li Yang, Ju Gao, Da-yun Tao, Yue-ju Wang, Jeffery L. Benntzen, Gao L. Z.*. 2014. Rapid diversification of five Oryza AA genomes associated with rice adaptation. Proc Natl Acad Sci USA 111 (46) E4954-E4962 (doi/10.1073/pnas.1418307111)
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56 Ju Gao, Shuo Wang, Gao L. Z.*. 2014. The complete chloroplast genome sequence of Phyllostachys sulphurea (Poaceae: Bambusoideae). Mitochondrial DNA (doi: 10.3109/19401736.2014.926516)
55 Ju Gao, Kui Li, Gao L. Z.*. 2014. The complete chloroplast genome sequence of Bambusa multiplex (Poaceae: Bambusoideae). Mitochondrial DNA (doi:10.3109/19401736.2014.926515)
54 Hui Huang, Chao Shi, Yuan Liu, Shu-yan Mao, Gao L. Z.*. 2014. Thirteen Camellia chloroplast genome sequences determined by high-throughput sequencing: genome structure and phylogenetic relationships. BMC Evolutionary Biology 14:151 doi:10.1186/1471-2148-14-151
53 Qun-jie Zhang, Gao L.Z.*. 2014. The complete chloroplast genome sequence of desert poplar (Populus euphratica). Mitochondrial DNA (DOI: 10.3109/19401736.2014.913159)
52 Fan-chun Zeng, Cheng-wen Gao, Gao L.Z.*. 2014. The complete chloroplast genome sequence of American bird pepper (Capsicum annuum var. glabriusculum). Mitochondrial DNA (DOI: 10.3109/19401736.2014.913160)
51 Xiao-di Hu, En-hua Xia, Gao L. Z.* 2014. The complete mitochondrial genome of eastern lowland gorilla, Gorilla beringei graueri,and comparative mitochondrial genomics of the Gorilla species. Mitochondrial DNA (doi:10.3109/19401736.2014.953103)
50 Xiao-di Hu, Kui Li, Gao L. Z.* 2014. The complete mitochondrial genome of celebes wild boar, Sus celebensis (Cetartiodactyla: Suina: Suidae) and comparative mitochondrial genomics of the Sus species. Mitochondrial DNA (doi:10.3109/19401736.2014.953099)
49 Xiao-di Hu, Gao L. Z.* 2014. The complete mitochondrial genome of domestic sheep, Ovis aries. Mitochondrial DNA (doi:10.3109/19401736.2014.953076)
48 Cheng-wen Gao, Shuo Wang, Gao L. Z.*. 2013. Complete mitochondrial genome of the black flying fox, Pteropus alecto (Chiroptera: Megachiroptera: Pteropodidae). Mitochondrial DNA (doi: 10.3109/19401736.2013.869691)
47 Jian-Jun Jiang, En-Hua Xia, Cheng-Wen Gao, Gao L. Z.*. 2013. The complete mitochondrial genome of the western painted turtle, Chrysemys picta bellii (Chrysemys, Emydidae). Mitochondrial DNA (doi:10.3109/19401736.2013.873900)
46 Xin-chun Mo, Ju Gao, Gao L. Z.*. 2013. Characterization of microsatellite markers and their application to genetic diversity analysis of Brachypodium sylvaticum var. breviglume from Yunnan, China. American Journal of Plant Sciences 4 (7):1427-1434.
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