周筱帆-华南农业大学植物保护学院

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周筱帆更新日期: 2025年9月12日

周筱帆，男，汉族，1983年10月生，湖北宜昌市人，民革，博士研究生学历，哲学博士，讲师，硕导。

个人简介

长期从事基因组学和生物信息学研究，目前研究方向主要包括：1）微生物基因组学；2）病原微生物致病分子机理与调控机制；3）生物信息学（比较基因组学和高通量测序数据分析等方向）。共发表SCI论文100余篇，其中第一/通讯作者论文54篇（包括《Cell》《Nature Genetics》《PNAS》《Genome Biology》等知名学术期刊）。担任SCI学术期刊《Frontiers in Ecology and Evolution》副主编和《Frontiers in Microbiology》客座副主编。主持和参与国家级、省级研究课题多项。2018年入选广东省“珠江人才计划”青年拔尖人才。

工作经历

2016–今：华南农业大学，首聘教授
2011–2016：美国范德堡大学，博士后

教育经历

2006–2011：美国宾夕法尼亚州立大学，细胞与发育生物学，博士
2001–2005：上海交通大学，生物技术，学士

获奖荣誉

广东省“珠江人才计划”青年拔尖人才（2018）

社会、学会及学术兼职

担任SCI学术期刊《Frontiers in Bioinformatics》和《Frontiers in Ecology and Evolution》副主编、《Frontiers in Microbiology》客座副主编。

研究领域

以植物病原微生物为主要研究对象，开展以下方向研究：
1. 微生物基因组学；
2. 病原微生物致病分子机理和调控机制；
3. 生物信息学（比较基因组学和高通量测序数据分析等方向）。

科研项目

1. 国家自然科学基金面上项目，32470184，青枯菌新双组分系统SwmSR的生物学功能和毒力调控机制研究， 2025.01-2028.12，50万元，在研，主持；
2. 国家重点研发计划项目，2022YFA1304401，华南地区重要粮油作物根际微生物组动态与作物病害发生及关键微生物的挖掘， 2022.12-2026.11，80万元，在研，主持子课题；
3. 广东省自然科学基金面上项目，2022A1515010223，转录调控因子PhcX对茄青枯劳尔氏菌的致病性调控研究，周筱帆，2022.01-2024.12, 10万元，结题，主持；
4. 广东省科技创新战略专项资金（重点领域研发计划）项目，基于代谢组学的水稻病虫抗性与产量平衡机制研究（2020B0202090001），2020.9-2023.8，1500万元，结题，主持课题；
5. 广东省林业厅科技创新项目，2020KJCX009，木麻黄青枯病防控资源挖掘与应用研究，2020-04至2024-12，200万元，在研，参与；
6. 广东省科技创新战略专项资金（重点领域研发计划）项目，2018B020205003，热带亚热带农业微生物种质资源研究与选育，2019-01至2021-12，700万元，在研，主持子课题；
7. 广东省林业厅科技创新项目，2018KJCX009，木麻黄青枯菌群体感应和群体淬灭系统研究，2018-06至2021-12，120万元，在研，参与；
8. 广东省农业厅重大重点项目培育项目，柑橘黄龙病病原生物学与防控应用基础研究，2018-07至2018-12，30万元，结题，参与；
9. 国家重点基础研究计划（973 计划），2015CB150600，微生物群体感应通讯系统与病害防控基础研究，2015-01至2019-08，2500万元，结题，主持子课题；

发表论文

近五年代表性论文：
1. Yixiao Zhu, Yonglin Li, Chuhao Li, Xing-Xing Shen*, Xiaofan Zhou*, A critical evaluation of deep-learning based phylogenetic inference programs using simulated data sets, Journal of Genetics and Genomics, 2025, 52(5):714-717. （中科院一区）
2. Xiaoqing Wang#, Hongyu Shi#, Xiaoyan Wu, Xuemei Chen, Shaobo Liu, Qinglin Yu, Lian-Hui Zhang*, Xiaofan Zhou*, Microbial diversity in coastal Casuarina equisetifolia forest and its potential in counteracting bacterial wilt infections, Pest Management Science, 2025, 81(8):4621-4634.（中科院一区）
3. Bo Feng#, Yonglin Li#, Biyang Xu#, Hongyue Liu, Jacob L Steenwyk, Kyle T David, Xiaolin Tian, Carla Gonçalves, Dana A Opulente, Abigail L LaBella, Marie-Claire Harrison, John F Wolters, Shengyuan Shao, Zhaohao Chen, Kaitlin J Fisher, Marizeth Groenewald, Chris Todd Hittinger, Xing-Xing Shen, Shengying Li, Antonis Rokas*, Xiaofan Zhou*, Yuanning Li*, Unique trajectory of gene family-evolution from genomic analysis of nearly all known species in an ancient yeast lineage, Molecular Systems Biology, 2025, 21(8):1066-1089.（中科院一区）
4. Yuwei Liang#, Qiang Gao#, Fan Li#, Yunpeng Du#, Jian Wu#, Wenqiang Pan, Shaokun Wang, Xiuhai Zhang, Mingfang Zhang, Xiaoming Song, Linlin Zhong, Fan Zhang, Yan Li, Zhiwei Wang, Danqing Li, Qing Duan, Shenchong Li, Chunlian Jin, Peihua Zhang, Yang Gu, Zhong-Hua Chen, Klaus F X Mayer*, Xiaofan Zhou*, Jihua Wang*, Liangsheng Zhang*, The giant genome of lily provides insights into the hybridization of cultivated lilies, Nature Communications, 2025, 16(1):45.（中科院一区）
5. Xiaohui Wen#, Yuwei Liang#, Hongyan Shan#, Xiaojun Chang#, Xiaoming Song#, Shaoqin Shen, Yanhong Fu, Dan Chen, Fei Chen, Yueqing Li, Qian Guan, Qiang Gao, Qi Wang, Yonglin Li, Zhengjia Wang, Hongzhi Kong, Huan Liu*, Xiang Gao*, Xiaofan Zhou*, Chris Thorogood*, Liangsheng Zhang*, The genome of giant waterlily provides insights into the origin of angiosperms, leaf gigantism, and stamen function innovation, Plant Communications, 2025, 6(6):101342.（中科院一区）
6. Xiaoqing Wang, Chuhao Li, Shaohua Huang, Huagui Gao, Yonglin Li, Xuemei Chen, Liangzhou Huang, Jianhua Luo, Lian-Hui Zhang*, Xiaofan Zhou*, Pathogenic and Comparative Genomic Analysis of Ralstonia pseudosolanacearum Isolated from Casuarina, Plant Disease, 2024, 108(9):2809-2819.
7. Xiuxiu Li#, Sheng Yu#, Zhihao Cheng#, Xiaojun Chang#, Yingzi Yun#, Mengwei Jiang#, Xuequn Chen, Xiaohui Wen, Hua Li, Wenjun Zhu, Shiyao Xu, Yanbing Xu, Xianjun Wang, Chen Zhang, Qiong Wu, Jin Hu, Zhenguo Lin, Jean-Marc Aury, Yves Van de Peer*, Zonghua Wang*, Xiaofan Zhou*, Jihua Wang*, Peitao Lv*, Liangsheng Zhang*, Origin and evolution of the triploid cultivated banana genome, Nature Genetics, 2024, 56(1):136-142.（中科院一区）
8. Qingmei Liu, Chuhao Li, Xiaohan Zhang, Mengfan Ding, Xinyue Liao, Jinli Yan, Ming Hu, Leilei Yang, Xiaoqing Wang, Lisheng Liao, Peng Li*, Xiaofan Zhou*, PhcX Is a LqsR-family response regulator that contributes to Ralstonia solanacearum virulence and regulates multiple virulence factors, mBio, 2023, 14(5):e0202823.（中科院一区）
9. Qian He#, Juming Li#, Qingmei Liu#, Yonglin Li, Xinyue Liao, Jianuan Zhou, Xiaofan Zhou, Complete genome sequence resource of Pantoea anthophila CL1 causing soft rot disease in Clausena lansium (Wampee) in China, Plant Disease, 2023, 107(5):1613-1616.（中科院二区）
10. Yuwei Liang#, Fan Li#, Qiang Gao#, Chunlian Jin, Liqing Dong, Qi Wang, Min Xu, Fuhui Sun, Bo Bi, Peng Zhao, Shenchong Li, Jiwei Ruan, Xiaofan Zhou*, Liangsheng Zhang*, Jihua Wang*, The genome of Eustoma grandiflorum reveals the whole-genome triplication event, Plant Biotechnology Journal, 2022, 20(10):1856-1858.（中科院一区）
11. Peng Yang, Haiying Zhao, Jieshu Wei, Yuanyuan Zhao, Xiaojing Lin, Jing Su, Fangping Li, Meng Li, Dongming Ma, Xukai Tan, Huilin Liang, Yewen Sun, Ruoting Zhan, Guozhen He*, Xiaofan Zhou*, Jinfen Yang*, Chromosome-level genome assembly and functional characterization of terpene synthases provide new insights into the volatile terpenoid biosynthesis of Wurfbainia villosa, Plant Journal, 2022, 112(3):630-645.（中科院一区）
12. Ming Hu, Yang Xue, Chuhao Li, Mingfa Lv, Lianhui Zhang, Matthew R Parsek, Guangtao Lu, Xiaofan Zhou*, Jianuan Zhou*, Genomic and Functional Dissections of Dickeya zeae Shed Light on the Role of Type III Secretion System and Cell Wall-Degrading Enzymes to Host Range and Virulence, Microbiology Spectrum, 2022, 10(1):e0159021.（中科院一区）
13. Mingfa Lv#, Yufan Chen#, Ming Hu, Qinglin Yu, Cheng Duan, Sixuan Ye, Jinfeng Ling, Jianuan Zhou, Xiaofan Zhou*, Lianhui Zhang*, OhrR is a central transcriptional regulator of virulence in Dickeya zeae, Molecular Plant Pathology, 2022, 23(1):45-59.（中科院一区）

教学活动

主讲《生物信息学》（全英）、《植物保护生物信息学》等本科生和研究生课程；参讲《植物保护研究进展》、《高级植物病理学》等研究生课程。

指导学生

指导博士后1名，在读博士研究生4名，硕士研究生10名；指导本科生大学生创新创业训练计划国家级项目1项，校级项目1项。

我的团队

胡明（博士后），王小晴（博士后）；刘清梅（2022级博士），陈文娟（2023级博士），李泳霖（2024级博士），陈慧琳（2025级博士）；蔡瑜静（2023级硕士），王兆雪（2023级硕士），邹少杰（2023级硕士），黄晨轩（2024级硕士），陶招金（2024级硕士），杨思琦（2024级硕士），曾欣诺（2024级硕士），潘思睿（2025级硕士），涂慧敏（2025级硕士），詹晓婷（2025级硕士）。