杨杰-华南农业大学动物科学学院/国家生猪种业工程技术研究中心

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杨杰更新日期: 2022年5月24日

杨杰，男，汉族，1987年6月生，湖南安乡县人，博士研究生学历，农学博士学位，副研究员，硕导。

个人简介

杨杰，男，博士，副研究员，硕导。江西省优秀博士论文获得者、广州市“珠江科技新星”、美国密歇根州立大学访问学者。主要致力于猪复杂经济性状的遗传解析工作，先后主持国家自然科学基金、广东省自然科学基金重点项目、广东省科技计划、广东省自然科学基金、华南农业大学青年科技人才专项基金等项目；获得授权国家发明专利21项，并在PLoS Genetics、BMC Genomics、Journal of Animal Science、Animal Genetics、Theriogenology和Frontiers in Microbiology等畜牧领域知名学术期刊发表学术论文40余篇。

工作经历

2019.01 – 至今：华南农业大学，国家生猪种业工程技术研究中心，副研究员；
2017.02 – 2018.12：华南农业大学，国家生猪种业工程技术研究中心，青年副教授；
2015.07 – 2017.02：华南农业大学，国家生猪种业工程技术研究中心，助理研究员。

教育经历

2017/08 – 2018/08，Michigan State University，Department of Animal Science，访问学者；
2009/09 – 2015/06，江西农业大学，猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室，动物遗传育种与繁殖，硕士、博士；
2005/09 – 2009/06，江西农业大学，动物科学技术学院，动物科学，学士。

获奖荣誉

2021年：五系配套瘦肉型猪选育关键技术与应用，神农中华农业科技奖一等奖（4/15）；
2020年：五元杂交瘦肉型种猪新配套系及其养殖技术示范推广，广东省农业技术推广奖一等奖（4/20）；
2019年：第20次全国动物遗传育种大会“优秀论文奖”（1/10）；
2018年：广州市“珠江科技新星”（1/60）；
2017年：江西省优秀博士学位论文（1/44）。

社会、学会及学术兼职

国家自然科学基金、广东省自然科学基金同行评审专家。担任Animal genetics、Animal、Frontiers in Genetics等多个学术期刊的审稿人。

研究领域

（1）利用大数据解析影响猪重要经济性状的主效基因。采用整合基因组、转录组、蛋白质组及表观遗传学的多组学研究手段，结合群体基因组学等手段，鉴别影响猪重要经济性状、遗传缺陷的关键基因，并结合细胞实验、小鼠实验及基因组编辑技术对关键基因开展功能验证，解析关键基因影响复杂性状的遗传机制；
（2）利用微生物组学破解猪消化道微生物影响经济表型的奥秘。采用宏基因组测序及16S rRNA扩增子技术，鉴别影响猪重要经济性状或复杂遗传疾病性状的消化道微生物，综合小鼠诱导模型及无菌小鼠粪菌移植技术，对关键微生物开展下游功能研究，从分子层面解析微生物影响猪重要经济性状的遗传机理。

科研项目

1. 国家自然科学基金面上项目，31972540，鉴别猪13号染色体影响悬蹄过度生长的目的基因及其关键突变，2020/01/01-2023/12/31，59万元，主持（1/8）；
2. 国家自然科学基金青年基金，31601912，猪8号染色体影响肌内脂肪含量QTL的遗传解析，2017/01/01-2019/12/31，20万元，主持（1/7）；
3. 广东省自然科学基金重点项目，2018B030315007，瘦肉型猪主要遗传缺陷基础性调查及遗传机制研究，2018/05/01-2021/04/30，50万元，主持（1/10）；
4. 广东省科技计划项目，2017B020201012，杜洛克种猪肉质性状遗传改良及专门化品系培育，2017/01/01-2019/12/31，50万元，主持（1/7）；
5. 广东省自然科学基金项目，2016A030310447，利用系统遗传学分析方法鉴别影响猪饲料转化效率的主效基因，2016/06/01-2019/06/01，10万元，主持（1/7）；
6. 广州市珠江科技新星项目，201906010011，大白种猪先天性趾蹄疾患的遗传机制研究，2019/04/01-2021/03/31，30万元，主持（1/6）；
7. 华南农业大学青年科技人才培育专项基金，2016-6，影响瘦肉型种猪肌内脂肪含量功能基因的挖掘，2016/06/01-2017/12/31，20万元，主持（1/1）。

发表论文

以第一或通讯作者在PLoS Genetics、BMC Genomics、Journal of Animal Science、Animal Genetics、Theriogenology和Frontiers in Microbiology等行业知名学术期刊发表高水平学术论文40余篇。部分代表性论文如下 (@corresponding authors; =co-first authors)：
12. Rongrong Ding =, Zhanwei Zhuang=, Yibin Qiu, Donglin Ruan, Jie Wu, Jian Ye, Lu Cao, Shenping Zhou, Enqin Zheng, Wen Huang, Zhenfang Wu@, Jie Yang@.(2022) Identify known and novel candidate genes associated with backfat thickness in Duroc pigs by large-scale genome-wide association analysis. Journal of Animal Science.DOI：skac012 (农林科学II区 TOP期刊)
11. Rongrong Ding, Yibin Qiu, Zhanwei Zhuang, Donglin Ruan, Jie Wu, Shenping Zhou, Jian Ye, Lu Cao, Linjun Hong, Zheng Xu, Enqin Zheng, Zicong Li, Zhenfang Wu@, Jie Yang@.(2021) Genome-wide association studies reveals polygenic genetic architecture of litter traits in Duroc pigs. Theriogenology. 173：269-278 (农林科学II区 TOP期刊)
10. Jie Wu=, Yong Ye=, Jianping Quan, Rongrong Ding, Xingwang Wang, Zhanwei Zhuang, Shenping Zhou, Qian Geng, Cineng Xu, Linjun Hong, Zheng Xu, Enqin Zheng, Gengyuan Cai, Zhenfang Wu@, Jie Yang@.(2021) Using Nontargeted LC-MS Metabolomics to Identify the Association of Biomarkers in Pig Feces with Feed Efficiency. Porcine Health Management.7：39 (生物II区 TOP期刊)
9. Zhanwei Zhuang, Rongrong Ding, Yibin Qiu, Jie Wu, Shenping Zhou, Jianping Quan, Enqin Zheng, Zicong Li, Zhenfang Wu@, Jie Yang@.(2021) A large-scale genome-wide association analysis reveals QTLs and candidate genes for intramuscular fat content in Duroc pigs. Animal Genetics. DOI: 10.1111/age.13069 (奶制品与动物科学II区)
8. Yibin Qiu=, Rongrong Ding=, Zhanwei Zhuang, Jie Wu, Ming Yang, Shenping Zhou, Yong Ye, Qian Geng, Zheng Xu, Sixiu Huang, Gengyuan Cai, Zhenfang Wu@, Jie Yang@.(2021) Genome-wide detection of CNV regions and their potential association with growth and fatness traits in Duroc pigs. BMC Genomics. 22：332(生物II区 TOP期刊)
7. Shenping Zhou=, Rongrong Ding=, Fanming Meng=, Xingwang Wang, Zhanwei Zhuang, Jianping Quan, Qian Geng, Jie Wu, Enqin Zheng, Zhenfang Wu, Jianhui Yang@, JieYang@.(2021) A meta-analysis of genome-wide association studies for average daily gain and lean meat percentage in two Duroc pig populations. BMC Genomics, 22:12 (生物II区 TOP期刊)
6. Zhanwei Zhuang=, Rongrong Ding=, Longlong Peng, Jie Wu, Yong Ye, Shenping Zhou, Xingwang Wang, Jianping Quan, Enqin Zheng, Gengyuan Cai, Wen Huang, Jie Yang@, Zhenfang Wu@.(2020) Genome-wide Association Analyses Identify Known and Novel Loci for Teat Number in Duroc Pigs using Single-Locus and Multi-Locus Models. BMC Genomics, 21:344 (生物II区 TOP期刊)
5. Jianping Quan=, Zhenfang Wu=, Yong Ye, Longlong Peng, Jie Wu, Donglin Ruan, Yibin Qiu, Rongrong Ding, Xingwang Wang, Enqin Zheng, Gengyuan Cai, Wen Huang@, Jie Yang@.(2020) Metagenomic characterization of intestinal regions in pigs with contrasting feed efficiency. Frontiers in Microbiology.DOI: 10.3389/fmicb.2020.00032 (生物II区 TOP期刊)
4. Rongrong Ding=, Ming Yang=, Jianping Quan, Shaoyun Li, Zhanwei Zhuang, ShenPing Zhou, Enqin Zheng, Linjun Hong, Zicong Li, Gengyuan Cai, Wen Huang, Zhenfang Wu@, Jie Yang@.(2019) Single-locus and multi-locus genome-wide association studies for intramuscular fat in Duroc pigs. Frontiers in Genetics.DOI: 10.3389/fgene.2019.00619 (生物II区)
3. Jianping Quan=, Gengyuan Cai=, Ming Yang, Zhonghua Zeng, Rongrong Ding, Wang Xingwang, Zhanwei Zhuang, Shenping Zhou, Shaoyun Li, Huaqiang Yang, Zicong Li, Enqin Zheng, Wen Huang, Jie Yang@, Zhenfang Wu@.(2019) Exploring the Fecal Microbial Composition and Metagenomic Functional Capacities Associated with Feed Efficiency in Commercial DLY Pigs. Frontiers in Microbiology.DOI: 10.3389/fmicb.2019.00052 (生物II区 TOP期刊)
2. Rongrong Ding=, Ming Yang=, Xingwang Wang, Jianping Quan, Zhanwei Zhuang, Shenping Zhou, Shaoyun Li, Zheng Xu, Enqin Zheng, Gengyuan Cai, Dewu Liu, Wen Huang, Jie Yang@, Zhenfang Wu@.(2018) Genetic Architecture of Feeding Behavior and Feed Efficiency in a Duroc Pig Population. Frontiers in Genetics.DOI: 10.3389/fgene.2018.00220 (生物II区)
1. Junwu Ma=, Jie Yang=, Lisheng Zhou, Jun Ren, Xianxian Liu, Hui Zhang, Bin Yang, Zhiyan Zhang, Huanban Ma, Xianhua Xie, Yuyun Xing, Yuanmei Guo, Lusheng Huang. (2014) A splice mutation in the PHKG1 gene causes high glycogen content and low meat quality in pig skeletal muscle. PLoS Genetics 10(10): e1004710. (生物I区；Doctor thesis).

科研创新

作为主要（前3）发明人，累计获得21件国家发明专利授权。部分代表性专利如下：
1、一种影响猪饲料转化率性状的分子标记及应用（1/7）, 授权日期：2017.07.11, 授权号：ZL201610113647.4
2、一种影响杜洛克种猪肌内脂肪含量的分子标记及应用（1/6），授权日期：2018.12.21，授权号：ZL201810183426.3
3、一种影响猪初生重性状的SNP分子标记及其应用（1/7）, 授权日期：2018.10.19, 授权号： ZL201710818477.4
4、一种影响猪主蹄生长的分子标记及其应用（1/6），授权时间：2018.10.30，授权号：ZL201711387533.X
5、一种影响杜洛克猪眼肌面积性状的分子标记及其应用（1/8），授权时间：2019.07.23，授权号：ZL201810337360.9
6、猪7染色体上与加系杜洛克眼肌面积、眼肌厚度相关的SNP位点（1/7），授权时间：2020.10.09，授权号：ZL201910403273.3
7、位于猪16号染色体上与猪瘦肉率和眼肌面积相关的SNP分子标记及应用（1/6），授权时间：2020.10.16，授权号：ZL201910403266.3

教学活动

以教书育人为重要的人生目标，主要从事《生物统计附试验设计》、《动物育种学》、《养猪学》的教学工作。

指导学生

培养宗旨：注重因材施教，将培养学生独立思考能力作为首要任务；积极与学生们一同编织梦想，鼓励学生们大胆破解畜牧学科的关键科学问题。特别欢迎愿意深入一线、并有志于长期在畜牧行业从业的同学们报考！也积极接纳数学、计算机、生物信息学等相关专业的同学跨专业报考！
培养现状：目前已直接或协助指导博士、硕士研究生30余名；协助多名同学获得国家留学基金委全额资助，与国外知名高校进行联合培养。

我的团队

我所在的团队先后牵头组建了国家生猪种业工程技术研究中心（科技部，2013）和畜禽育种国家地方联合工程研究中心（发改委，2014）两个国家级科研平台；并牵头成立了广东省级畜禽种质资源库（广东省农业农村厅，2018）。团队长期致力于种猪分子遗传改良及专门化品系培育工作，近年来，团队共承担农业部转基因重大专项和科技部“863”等国家级和省级项目90余项；先后主持获得了国家科技进步二等奖1项（2018）、神农中华农业科技奖一等奖1项（2021）、广东省科学技术奖一等奖2项（2011、2016）、广东省农业技术推广奖一等奖3项（2011、2015、2020）、全国农牧渔业丰收奖农业技术推广合作奖1项（2016）和大北农科技奖一等奖1项（2013）等；另有“华农温氏I号猪”（2006）、“温氏WS501猪”（2015）2个通过国家畜禽新品种（配套系）审定的配套系。实验室现有使用面积3431平方米，拥有完善的动物遗传学、分子生物学和基因组学研究设备，仪器设备价值2700余万元。团队先后完成了14余万头主流瘦肉型种猪及5万余份华南地方猪表型数据库和组织样本库的构建，并与畜牧龙头企业温氏集团拥有长达24年的“产、学、研”合作基础，现已具备东成试验场、三和试验场和车岗试验场3个科研用途的试验猪场，用以配合课题组的各项个性化科研任务；另有沙湖原种猪场、水台原种猪场等23个覆盖全国的产业化育种基地，科研环境良好。